期刊简介
本刊是全国生物医学工程工作人才沟通学术思想、交流学术经验的园地。报道有创造性的最新科研论文和研究简讯。包括学科有：人工器官和生物医用材料，生物效应，生物信息与控制；生物力学；生物医学仪器；中医工程；临床工程等。读者对象是国内外生物医学工程学工作者、医务工作者以及其他从事自然科学研究和有关工程技术人员。
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首页>中国生物医学工程学报杂志
- 杂志名称：中国生物医学工程学报杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中国生物医学工程学会
- 国际刊号：0258-8021
- 国内刊号：11-2057/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：医学文摘, 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 文摘与引文数据库, 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 上海图书馆馆藏, SA 科学文摘(英), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), CA 化学文摘(美), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 知网收录(中)
Oligo基因芯片的异常值处理对有监督疾病分类的影响
吕莹丽；王栋；郭政；于梁梁；李彦辉；朱晶；王晨光
关键词：基因表达谱, 异常值分类, 功能表达谱
摘要：基因芯片实验产生的表达谱数据中存在大量不合格的检测点,对异常值的不同处理,对于有监督疾病分类结果的影响很大.针对此问题,在Oligo芯片数据中,在表达水平层面,通常对检测值做大值和小值的预处理后,进行后续分析.本研究选取了四套Oligo芯片数据集,采用不同限定芯片数据中大值和小值的方法,考察支持向量机、K近邻、决策树三种分类器对分类疾病样本效能的影响程度.结果 显示:Dudoit等限定大值和小值分别为16000和100是一种合理的策略,可以达到很好的分类效果.同时发现对于小于100的检测值较多的数据集,采用限定小值为10的策略同样能得到很好的分类效果,并可以为后续分析保留更多的原始数据.因此,合理限制Oligo芯片中的异常值,对于提高疾病分型是一种较好的策略.进一步采用功能表达谱方法,构造反映功能结点中全部注释基因的总体表达状态的均值或中值指标,利用构建的功能表达谱进行分类分析.发现不同异常值的限定方法对基于功能表达谱进行分类得到的准确率的影响较小,可以获得较稳定的分类结果.
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