期刊简介

本刊是全国生物医学工程工作人才沟通学术思想、交流学术经验的园地。报道有创造性的最新科研论文和研究简讯。包括学科有:人工器官和生物医用材料,生物效应,生物信息与控制;生物力学;生物医学仪器;中医工程;临床工程等。读者对象是国内外生物医学工程学工作者、医务工作者以及其他从事自然科学研究和有关工程技术人员。

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  • 杂志名称:中国生物医学工程学报杂志
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国生物医学工程学会
  • 国际刊号:0258-8021
  • 国内刊号:11-2057/R
  • 出版周期:双月刊
期刊荣誉:中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录:医学文摘, 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 文摘与引文数据库, 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 上海图书馆馆藏, SA 科学文摘(英), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), CA 化学文摘(美), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 知网收录(中)
中国生物医学工程学报杂志2012年第04期

一种生物相关性优先的两步卵巢癌化疗疗效敏感基因选取方法

韩斌;王清;解瑞飞;厉力华;祝磊

关键词:卵巢癌化疗疗效, 有监督奇异值分解(SSVD), 特征选取, 随机森林, 决策树
摘要:作为卵巢癌主要诊疗手段之一的化疗,费用昂贵,副作用大,且患者反应的个体差异很大.本文提出一种首先依据诊断结果(卵巢癌化疗疗效)相关性进行特征选择,然后利用蒙特卡洛方法对特征基因排序,终建立预测化疗反应模型的方法,克服了过度依赖分类率的弊端.首先利用奇异值分解,基于散点图和Kolmogorov-Smimov test(K-S test)的定性和定量分析非生物因素对基因表达谱的影响,结合化疗反应样本的聚类图进行基因筛选;然后采用基于信息增益的随机森林方法精选基因,得到与化疗相关的敏感基因.实验结果表明,此方法与经典方法( SVMRFE、T-test)相比,所选取出的特征基因具有较好的分类能力且保持稳定;从生物学角度分析显示,此方法所得到的敏感基因与化疗疗效的联系更加紧密,50个基因中,有4个( NR2F2、CLDN3、PURA、ClORF38)直接与卵巢癌相关;17个(US01、TCF7L2、NR2F2等)与肿瘤或癌症直接相关,或与肿瘤密切相关的生物过程(例细胞生长与繁殖、新陈代谢、细胞循环、DNA修复等)相关.