期刊简介
本刊是全国生物医学工程工作人才沟通学术思想、交流学术经验的园地。报道有创造性的最新科研论文和研究简讯。包括学科有：人工器官和生物医用材料，生物效应，生物信息与控制；生物力学；生物医学仪器；中医工程；临床工程等。读者对象是国内外生物医学工程学工作者、医务工作者以及其他从事自然科学研究和有关工程技术人员。
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首页>中国生物医学工程学报杂志
- 杂志名称：中国生物医学工程学报杂志
- 主管单位：中国科学技术协会
- 主办单位：中国生物医学工程学会
- 国际刊号：0258-8021
- 国内刊号：11-2057/R
- 出版周期：双月刊
期刊荣誉：中国期刊全文数据库(CJFD)期刊收录：医学文摘, 万方收录(中), 统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), CSCD 中国科学引文数据库来源期刊(含扩展版), 文摘与引文数据库, 国家图书馆馆藏, 维普收录(中), 上海图书馆馆藏, SA 科学文摘(英), JST 日本科学技术振兴机构数据库(日), CA 化学文摘(美), 北大核心期刊(中国人文社会科学核心期刊), 知网收录(中)
蛋白质数据库对蛋白质组鉴定的影响
邵晨；孙伟
关键词：蛋白质数据库, 蛋白质组学, 数据库检索
摘要：在蛋白质组学研究中,通常使用数据库检索算法进行蛋白质的鉴定.使用完整性较高但注释不准确的数据库,可能能够鉴定到更多的蛋白质,但存在数据不准确的风险；使用注释准确但完整性较低的数据库,则有可能漏掉一些数据库中未收录的蛋白.如何兼顾蛋白质鉴定结果的完整性和准确性是一个重要的问题.本研究以人类蛋白质组为例,采用不同质谱仪及不同样品产生的蛋白质组数据,比较了常用的IPI数据库、UniProt数据库和Swiss-Prot数据库的检索结果.结果表明,3个数据库在不同的蛋白质组数据中表现各有优劣,但总体来讲差异很小；每个数据库可鉴定到的、特有的多肽数不超过总数的5％,蛋白数的差异为1％～5％.说明3个数据库都覆盖了常见的人类蛋白序列,完整性很高.因此,推荐采用通过人工注释、在不断更新中的Swiss-Prot数据库作为检索对象.当研究目的为鉴定或定量未收录在Swiss-Prot数据库中的蛋白序列(如一些特殊的蛋白异构体或突变体)时,可将目的序列加入该数据库进行检索,或考虑使用其他完整性更高的数据库.
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